El ámbito cronológico-cultural de la Protohistoria que nos permite conocer el MAN a través de sus colecciones comprende los inicios de la Edad del Hierro y el Primer Milenio a. C. De las numerosas piezas reunidas, procedentes de hallazgos y excavaciones arqueológicas en la Península, encontramos muestras funerarias tan valiosas como el monumento de Pozo Moro. La torre, ahora restituida, fue levantada a finales del siglo VI a. C sobre la tumba de un personaje de alto rango y es interpretada como influencia directa de los colonizadores fenicios instalados en el sur. En su construcción, con una estructura de tres partes diferenciadas, se puede ver el dominio de las técnicas de cantería. Alrededor se siguió enterrando a su descendencia, formando una gran necrópolis ibérica.
